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實驗室管理系統LIMS可以有效地減少因為人為失誤而導致的錯誤，從而使其在質量控制方面有十分有效的作用。
實驗室質量控制是為將分析測試結果的誤差控制在允許限度內所采取的控制措施。傳統意義上，我們通過實驗室內質量控制和實驗室間比對來進行實驗室的質量控制。在實驗室內，質量控制一般包括空白實驗、校準曲線的核查、儀器設備的標定、平行樣分析、加標樣分析以及使用質量控制圖等。實驗室間比對包括分發標準樣對諸實驗室的分析結果進行評價、對分析方法進行協作實驗驗證、加密碼樣進行考察等。它是發現和消除實驗室間存在的系統誤差的重要措施?？梢酝ㄟ^LIMS進行實驗室質量的控制。
LIMS對質量控制方面的管理體現在兩方面，首先是有計劃、有目的和針對性的對考核樣的處理以及實驗室內部和實驗室間的比對試驗和評價。另一個方面就是在日常檢測工作中對質控樣品的處理，檢測儀器校準曲線,檢測結果趨勢圖和控制圖等。
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